基于多组学数据整合分析二硫化物
凋亡相关基因在缺血性卒中免疫
微环境中的作用

doi:10.12124/j.issn.2095-3933.2026.1.2025-6208

心电与循环

2026, Vol. 45

Issue (01): 61-67 DOI: 10.12124/j.issn.2095-3933.2026.1.2025-6208

临床研究

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基于多组学数据整合分析二硫化物凋亡相关基因在缺血性卒中免疫微环境中的作用

庞晓飞邱东付红

金华市中医医院康复治疗部

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摘要目的通过生物信息学方法探讨二硫化物凋亡相关基因的差异表达及其在缺血性卒中（IS）免疫微环境中的潜在作用。方法通过基因表达综合数据库获取 IS 的全基因组表达数据，采用 ComBat 法校正批次效应，并通过主成分分析评估数据整合效果。使用 R 4.3.1 软件进行差异表达基因（DEG）分析、基因集富集分析（GSEA）、基因集变异分析（GSVA），通过加权基因共表达网络（WGCNA）和蛋白质 - 蛋白质相互作用（PPI）网络筛选关键基因，并对关键基因进行基因本体论富集分析、ROC 曲线分析，同时分析其与免疫细胞的相关性。通过 StarBase 数据库筛选并构建 RNA 结合蛋白（RBP）-mRNA 调控网络。结果 IS 组和对照组共鉴定出 302 个 DEG。GSEA 显示，IS 患者核苷酸结合寡聚化结构域样受体、Toll 样受体等炎症相关通路上调，氨酰 - 转运 RNA 生物合成等代谢相关通路下调；GSVA 显示，IS 患者视黄醇代谢、α- 亚麻酸代谢等代谢相关通路上调，牛磺酸和亚牛磺酸代谢、氨酰 - 转运 RNA 生物合成等通路下调。WGCNA 识别出 13 个共表达模块，其中标记为蓝绿色的共表达模块包含 693 个基因，进一步筛选得到 13 个二硫化物凋亡相关的关键基因，这些基因大部分与二硫化物凋亡评分呈中度相关（均 P＜0.05）。PPI 网络分析显示，STT3A、KL、NUMB、SLC22A4、ZBTB25、IKBIP、CDR2、TMTC1、ZBTB24、TCL1A、 GPR183、NR1D2 等 12 个关键基因具有紧密关系，主要富集于寡糖基转移酶复合物、内质网蛋白复合物、水解酶活性及细胞的顶端部分等生物学过程。ROC 曲线分析显示，STT3A（AUC=0.801）、KL（AUC=0.740）、NUMB（AUC=0.705）等基因对 IS 的诊断效能较高。IS 患者免疫细胞浸润模式发生明显改变，其中 TCL1A、CDR2 与活化 B 细胞呈正相关（r=0.752、0.557，均 P＜ 0.01）。RBP-mRNA 调控网络分析显示 347 种调控关系，涉及 71 个 RBP 和 11 个 mRNA。结论二硫化物凋亡可能在 IS 的病理及生理过程中发挥关键作用，并可能为 IS 的诊断和治疗提供新的潜在靶点。

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引用本文:

庞晓飞邱东付红. 基于多组学数据整合分析二硫化物凋亡相关基因在缺血性卒中免疫微环境中的作用[J]. 心电与循环, 2026, 45(01): 61-67.

链接本文:

http://www.xdyxh.com/CN/10.12124/j.issn.2095-3933.2026.1.2025-6208 或 http://www.xdyxh.com/CN/Y2026/V45/I01/61