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hsa_circ_0134625对冠心病的预测价值及潜在调控机制研究 |
陈钰丹 柴佳丽 姚徐馨 陆浩轩 赵希雅 谢燕青 |
宁波大学附属第一医院心血管内科 |
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摘要 目的探索hsa_circ_0134625对冠心病的预测价值及潜在调控机制。方法基于高通量测序结果筛选冠心病患者血浆中差异表达的环状RNA(circRNA)。回顾性选取2022年7月至2023年12月在宁波大学第一附属医院行冠脉造影检查的患者161例(包括冠心病组81例和对照组80例),采集血液并检测比较两组对象hsa_circ_0134625表达水平,采用logistic回归分析冠心病与临床特征的关系;采用logistic回归、极限梯度提升树、高斯朴素贝叶斯方法构建冠心病预测模型,采用ROC曲线评估模型性能,基于沙普利加和解释(SHAP)对最优模型进行事后分析。基于生物信息学方法和公共基因表达综合数据库构建circRNA-微小RNA(miRNA)-信使RNA调控网络并进行功能富集分析,推测hsa_circ_0134625在冠心病发病过程中的潜在调控机制。结果冠心病组hsa_circ_0134625表达水平明显高于对照组[1.44(1.02,1.76)比1.02(0.66,1.60),P=0.010]。hsa_circ_0134625是冠心病的独立预测因子(OR=1.720,95%CI:1.145~2.584,P=0.009)。基于hsa_circ_0134625预测冠心病的AUC为0.629(0.540~0.718);而基于hsa_circ_0134625联合临床数据构建的预测模型中,以极限梯度提升树算法的预测模型综合性能最佳,分类准确度、AUC分别为0.730、0.818。SHAP分析显示该模型中hsa_circ_0134625对冠心病的预测具有重要影响。生物信息学分析显示hsa_circ_0134625与hsa-miR-515-5p、hsa-miR-646、hsa-miR-639表达有关;通路富集分析显示,主要与磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B、叉头框转录因子和血管内皮生长因子信号通路有关。结论hsa_circ_0134625在冠心病患者血浆中呈高表达,有望成为预测冠心病的生物学标志物;调控网络揭示了hsa_circ_0134625在冠心病的发生、发展中的潜在调控机制。
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